Marcos Jourón, tras la salida de David Galeano fue el productor de la última versión (PC Fútbol 2001) de la época de Dinamic Multimedia. El América terminó invicto con cuatro victorias y un empate, para nueve puntos (en la época el triunfo atribuía dos puntos), mientras Santa Fe y San Lorenzo igualaron a seis puntos, con tres victorias y dos derrotas; se anunció un desempate que, al parecer, nunca se jugó. Como el propio Club reconoció, se procedió a la elección del Celtic FC por los importantes lazos entre Euskadi y Escocia, por la admiración a otro club también creado en una época de penuria económica, así como por la importancia de la temática escocesa con la principal peña armera «Eskozia la Brava». El Tournoi de Paris, también conocido como Trophée de Paris, es una competición de fútbol de pretemporada organizada por el club francés Paris Saint-Germain en su Parc de Princes, en París, Francia. Las obras en el estadio supusieron para el club una deuda acumulada importantísima que se tradujo en un equipo cada vez más debilitado. En el apartado de bajas la más destacada fue la de Shon Weissman que tras una mala primera vuelta debido al principio por motivos personales y posteriormente por la falta de confianza del entrenador acabó saliendo cedido con opción de compra condicionada al Granada C. F. de la segunda división.
La temporada 2022-23 empezó con Pacheta como entrenador tras su ascenso y fichajes como la vuelta del canterano Sergio Asenjo o el vallisoletano Sergio Escudero. Barcelona con gol de Fausto Rossi y el empate ante el Real Madrid 1-1 con goles de Osorio y Sergio Ramos. En Argentina jugó en los clubes Boca Juniors, Banfield, Gimnasia y Esgrima de La Plata, Talleres de Córdoba, Chacarita Juniors; el Real Madrid Castilla C. F. de España, el Blooming de Bolivia, Deportes Tolima y Unión Magdalena de Colombia, Everton de Chile y Deportivo Táchira, Atlético El Vigía y Minervén de Venezuela. Esta temporada dejó el primer partido televisado en directo al Real Murcia, el que disputó en el Estadio Metropolitano ante el Atlético de Madrid y que perdió 2 a 1. La campaña siguiente supuso un nuevo descenso a Segunda División, al finalizar decimoterceros y perder la promoción. 320. Diario Marca. Descendió como colista con 18 puntos, junto a Osasuna y Arenas de Guecho, este último tras haber perdido la Promoción.
También cabe destacar un nuevo fracaso en un mercado de invierno en este caso con Jovane Cabral del Sporting de Portugal que iba a llegar en calidad de cedido hasta final de temporada pero que según el club por problemas en la plataforma de la FIFA los documentos llegaron fuera de plazo, no así en la liga. Se han arreglado los problemas con el Online Pass y un pequeño problema con los dorsales de los jugadores de la Master League Online ha sido corregido. Desde la temporada 2004-05 cuenta también con un gimnasio equipado con maquinaria de entrenamiento para la preparación física de los jugadores. La temporada 16/17 empezó con Paco Herrera como nuevo entrenador y con una plantilla ampliamente remodelada de la cual solo continuaron 3 jugadores de la anterior temporada. La temporada 2021-22 fue su 36ª temporada en la división de plata en la que el objetivo sería recuperar la ilusión de la afición con el equipo tras una de las peores temporadas de la historia del club. Sylla cuando la afición esperaba varios fichajes y que además fueran de nivel para poder revertir el mal comienzo de temporada que comenzó con una victoria en la primera jornada pero en los tres siguientes partidos cayó derrotado y además sin lograr marcar ningún gol.
Sin embargo no logró revertir la tendencia irregular del equipo y en la última jornada jugando en casa contra el Getafe el Valladolid volvió a descender, acumulando 5 descensos en los últimos 20 años. Finalmente el equipo se salvó matemáticamente en la antepenúltima jornada y quedó 13.º, el mejor puesto en las últimas 18 temporadas. Cuando fue presentado Ronaldo el equipo llevaba ya jugadas las tres primeras jornadas de la Liga 18-19 y aunque no consigue marcar ningún gol empata dos de sus tres encuentros gracias a la solidez defensiva. El último partido antes del parón por el Mundial 2022 fue una dura derrota por 3-0 en Bilbao, pero la vuelta fue aún más dura con la eliminación en 1/16 de final contra el Deportivo Alavés de la segunda división y otras 5 derrotas en liga sin ni siquiera lograr un gol. La vuelta a la primera división comenzó con una dura derrota contra el Villarreal C. F. en casa pero a pesar de ello logró enderezar la situación llegando a estar clasificado en una meritoría 10.ª posición tras lograr 3 victorias en 4 partidos a mitad de la primera vuelta, destacando la goleada por 4-1 al R. C. Celta de Vigo y una victoria por la mínima frente a la Real Sociedad que hasta ese momento estaba cuajando una gran temporada.
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