El 7 de julio de 2011, el club grancanario confirmaba su disolución como club de fútbol tras su descenso a Tercera División por impagos denunciados por la Asociación de Futbolistas Españoles y ante la imposibilidad de asumir una deuda que rondaba los dos millones de euros, camisetas de futbol por la cual tenía los ingresos bloqueados. Si hablamos de éxitos deportivos, el equipo grancanario posee 2 ascensos (1 a Segunda División B y 1 a Segunda). La llegada de nuevos fichajes hace efecto y el Universidad realiza una gran temporada finalizando en segunda posición, solo a seis puntos del líder, el Real Madrid B. De nuevo en la promoción de ascenso, con el nuevo sistema de eliminación, el cuadro grancanario es eliminado a las primeras de cambio por el C.D. ↑ A pesar de que en el marco de la FIFA Gales posee autonomía deportiva, así como las demás naciones constitutivas británicas, en lo referente al Comité Olímpico Internacional es en cambio el Reino Unido quien está adherido. En 1991, la FIFA empezó a realizar las Copas Mundiales de Fútbol Femenil. El equipo continuó jugando en Maspalomas, y a pesar de la buena campaña del conjunto universitario que termina en cuarta posición, el descenso a Segunda División A de la U. D. Las Palmas provoca que el equipo, como filial de los amarillos, no pueda disputar la liguilla de ascenso a la división de plata.
Algunas derrotas por la mínima y empates cosechados en casa cuando se ganaban los encuentros, hicieron que el conjunto azul marino estuviera siempre en los puestos bajos de la tabla. En la temporada 2002/2003, el club negocia la desvinculación del conjunto universitario de la entidad amarilla y se desliga de la UD Las Palmas. Español de Las Margaritas, el C. D. Patria, el C. D. Santa Marina, el C. D. Ciudad Jardín, la U. D. Ferroviaria en la Estación Central, el C. D. San Lorenzo, el C. D. Coliseo o el C. D. San Rafael, a los que más tarde se incorporarán el Imperial F. de J., el C. D. Cruz Roja, el C. D. Español de Santiago, el C. D. Perla, el C. D. Juventud, el C. D. Cenemesa y el C. D. Candelaria, destacando por encima de todos, el Club Deportivo Electro Mecánica, quien originado en la misma empresa de años antes, tuvo un momento de esplendor a finales de los años cuarenta, ascendiendo y militando en Tercera División. Actualmente juega en el Grupo VIII de Tercera División,donde ha superado ampliamente los 1000 partidos disputados. En 1975 Ecuador jugó la edición de la Copa América donde empató 2-2 con Paraguay pero terminó último lugar de su grupo después de perder los otros partidos.
Curiosamente, el Getafe C.F., que ocupó el lugar dejado por el Universidad, logró ascender a Segunda División. Juande Ramos, el entrenador que más títulos ha conseguido para el Sevilla, consiguiendo un hito sin precedentes en la historia de la entidad. El Universidad de Las Palmas acumuló en sus años de historia varios trofeos. En la temporada 2010/2011, el Universidad llega, por primera vez en su historia, a los dieciseisavos de final de la Copa del Rey. A lo largo de su historia, la entidad cambió su denominación por diversas circunstancias hasta la última de Universidad de Las Palmas de Gran Canaria Club de Fútbol. El club usaba también otras instalaciones de la ciudad para realizar sus entrenamientos, o bien, para acoger los partidos de sus filiales. En la temporada 2003/2004, el Universidad comenzó la temporada jugando sus partidos como local en el Estadio Insular. El 4 de diciembre de 1992, el R. C. D. Español se inscribe en el Registro Mercantil como Sociedad Anónima Deportiva, y poco después, el 6 de julio de 1994 se crea el R. C. D. Español «B» al absorber los derechos federativos del FC Cristinenc, de Santa Cristina de Aro.
En 1994 la RFEF pasa el control del campeonato a una recién creada Comisión Nacional de Fútbol Sala, dependiente de la Federación. Tras posteriores expedientes, la situación de irregularidad se amplió hasta alcanzar una veintena de jugadores de la cantera, a los que se les prohibió alinearse con el club azulgrana, así como usar sus instalaciones -incluyendo la residencia en La Masía- hasta alcanzar la edad reglamentaria. Cabe destacar sus 3 títulos del Memorial Carlos Fuentes, así como un Torneo de San Ginés y un Trofeo Teide. En enero del 2012, pese a la creciente popularidad de sus videos, anunció que se cambiaba de cuenta, porque la que tenía en ese momento no podía asociarse a un contrato con la network Machinima, Inc. Ceuta, siendo ese promedio de 64,7 puntos. Ese mismo año se lanzó la primera zapatilla deportiva con microprocesador, la Adidas 1, camiseta de fútbol fruto de más de 20 años de desarrollo. Durante los años mezcló el azul marino con ribetes amarillos o blancos. Con el resultado parcial empatado en uno. En cuanto a la Copa del Rey, los dieciseisavos de final que alcanzó en la temporada 2010-11 fue su mejor resultado.